Xel-Há alberga a más de 270 especies de plantas, muchas de las cuales se encuentran amenazadas por la deforestación para el desarrollo urbano, y la sobreexplotación de los valiosos recursos que representan. Xel-Há tiene una firme política de reubicación para que el desarrollo de sus construcciones no afecte a la vegetación. Asimismo, se mide cuidadosamente el impacto ambiental de cada proyecto, para preservar nuestra Maravilla Natural para futuras generaciones.

El Vivero es un jardín botánico al aire libre en el cual se atiende a una variedad enorme de vegetación nativa. Una vez que las plantas alcanzan un tamaño competente, éstas se reubican en la vasta selva de Xel-Há. Un tour guiado que explica las riquezas que alberga el Vivero sale varias veces al día desde el Módulo de Información cerca de la Caleta.